Bij Copa Airlines kun je snel en makkelijk inchecken op verschillende manieren. Zo kan je onder andere online inchecken. Je kunt je stoel kiezen en de instapkaart vanaf 36 tot 1 uur voor vertrek uitprinten. Voor de Verenigde Staten kan dit vanaf 24 uur van tevoren. Je kunt ook kiezen voor een mobiele boardingpass op je smartphone of gebruikmaken van de check-in balie op de luchthaven.